5-氨基-2-氯吡啶属于UN 2811危险品，运输时需分类为6.1有毒物质。使用专用容器如PE桶或玻璃瓶，填充率不超过90%。
陆运要求车辆配备泄漏应急设备，并张贴相应危险品标签。避免与氧化剂共运，以防化学反应。
海运遵守IMDG代码，需提供MSDS和危险申报。集装箱应通风良好，温度控制在5-30℃。
存储环境应干燥、通风，远离火源和强酸。货架高度不超过1.5米，使用防滑托盘防止倾倒。
物流企业需培训员工处理潜在泄漏，使用中和剂如碳酸氢钠吸收。定期检查包装完整性。
国际物流中，注意目的地法规差异，如欧盟。