锦鲤常见疾病包括白点病（小瓜虫寄生）、肤霉病（水霉菌感染）、烂鳃病（细菌或寄生虫引起）、炸鳞病、肠炎病等。症状多表现为体表异常、食欲下降、游动异常。

治疗原则为对症下药：寄生虫病用亚甲基蓝或敌百虫药浴，细菌病用抗生素泼洒或内服，病毒性疾病注重隔离与增强免疫。水霉病可用食盐水浸洗。

预防措施强调水质稳定、饲料新鲜、操作轻柔，避免机械损伤与交叉感染，定期消毒池塘与工具。